Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian ada sejak Fakultas Pertanian UGM berdiri, yaitu berdasarkan Peraturan Pemerintah No.37 Tahun 1950 dengan nama Seksi Penyelidikan Ekonomi Pertanian yang dipimpin oleh Almarhum Prof. Iso Reksohadiprodjo (Ahli Ekonomi Pertanian pertama di Indonesia). Sejak tahun 1972 dengan berlakunya sistim kredit, seksi tersebut diubah namanya menjadi Departemen Ekonomi Pertanian, dan pada tahun 1984 diubah lagi namanya menjadi Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian.
Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian mengembangkan ilmu-ilmu sosial ekonomi pertanian yang melihat pertanian dari tingkah laku manusianya dan kaitannya dengan keadaan masyarakat secara keseluruhan.
Dalam rangka menyesuaikan diri dengan Program Pendidikan Sarjana Pertanian seperti tertuang dalam SK Mendikbud No. 0411/U/1994, Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian mempunyai dua program studi, yaitu Program Studi Ekonomi Pertanian dan Agribisnis serta Program Studi Penyuluhan dan Komunikasi Pertanian. Program Studi Ekonomi Pertanian dan Agribisnis terdiri atas dua konsentrasi studi yaitu Ekonomi Pertanian dan Agribisnis. Pada program Studi Penyuluhan dan Komunikasi Pertanian terdapat satu konsentrasi studi yaitu Penyuluhan dan Komunikasi Pertanian.
Program Studi Ekonomi Pertanian dan Agribisnis mengembangkan ilmu-ilmu ekonomi pertanian, meliputi segi mikro yang terutama berhubungan dengan pengelolaan usahatani dan pemasaran pertanian, serta segi makro yang berkaitan dengan alih teknologi di bidang pertanian.
Program Studi Penyuluhan dan Komunikasi Pertanian mengembangkan ilmu-ilmu penyuluhan pertanian meliputi segi mikro yakni pengelolaan penyuluhan di tingkat petani dengan pemahaman kondisi masyarakat desa, dan segi makro yang berkaitan dengan alih teknologi di bidang pertanian disertai dengan pemahaman dan pengembangan penyebaran informasi pertanian.
Untuk mendukung kegiatan proses belajar mengajar, Jurusan Sosial Ekonomi Pertanian mengelola 10 laboratorium (6 laboratorium dikelola oleh PS. Ekonomi Pertanian dan Agribisnis, 3 laboratorium dikelola PS. Penyuluhan dan Komunikasi Pertanian dan 1 laboratorium dikelola bersama oleh kedua PS).
