Departemen Sosial Ekonomi Pertanian sebagai salah satu Center if Excelent telah didirikan sejak awal berdirinya Universitas Gadjah mada. Berdasarkan PPN No. 37 Tahun 1950, didirikan dengan nama Seksi Penyelidikan Ekonomi Pertanian yang dipimpin oleh Prof. Iso Reksohadiprojo (pakar ekonomi pertama di Indonesia). Nama departemen ini kemudian berubah menjadi departemen ekonomi pertanian pada tahun 1972 dan kemudian berganti nama lagi menjadi Departemen Sosial Ekonomi Pertanian di 1984.
Departemen ini mengembangkan keilmuan di bidang sosial ekonomi pertanian berdasarkan perspektif perilaku sosial ekonomi masyarakat dan hubungannya dengan kondisi masyarakat.
Departemen Sosial Ekonomi Pertanian memiliki dua program studi, (1) Program Studi Ekonomi Pertanian dan Agribisnis, dan (2) Program Studi Penyuluhan dan Komunikasi Pertanian
